军口863项目的实施流程包括三个重要阶段：
（1）申请及立项；（2）年度检查；（3）结题验收。
涉密项目办理注意事项：
1、办理涉密科研项目有关事项必须为该课题参研人员中的涉密人员；
2、项目执行过程中所有涉密文档应在涉密机中处理；
3、项目申报、立项、实施、验收、归档及成果申报过程中，对涉密载体的产生、传递与管理应符合国家和学校的保密管理规定。
项目合同及经费管理
1、科研项目经费拨款（上本）
2、分承包/外协合同办理流程
3、分承包款/外协费审批流程
4、科研经费购置仪器设备流程
5、项目结余经费结算分配
（略，参见“科研经费管理流程”和“科技合同管理流程”）
